李亦学，男，博士生导师，广州实验室特聘研究员，国家生物数据中心体系粤港澳大湾区节点平台首席科学家兼主任，中国科学院上海生命科学研究院营养与健康研究所生物医学大数据中心主任，上海生物信息学会理事长，复旦大学泰州健康科学研究院科学顾问、生命科学家，上海交通大学教授，复旦大学遗传学教育部协同创新中心前沿生物技术部主任。
1978年2月至1982年2月，李亦学就读于新疆大学。1984年9月至1987年7月，李亦学在新疆大学攻读硕士；1992年10月至1996年10月，李亦学获海德堡大学理论物理博士学位。1996年10月至1997年2月，李亦学在斯图加特大学从事博士后研究；1997年2月至2000年6月，李亦学在欧洲分子生物学实验室进行博士后工作。2000年6月至2002年12月，李亦学任中国科学院上海生命科学研究院研究员。2002年2月至2023年12月，李亦学任上海科学院上海生物信息技术研究中心主任。2007年1月至2017年12月，李亦学任上海交通大学生命科学与技术学院生物统计学与生物信息学系系主任。2021年4月起，李亦学任广州实验室研究员。李亦学主要从事蛋白质组学、系统生物学研究，使用神经网络、统计物理等方法从事与脱氧核糖核酸序列相关的软件开发研究，特别发展了时间序列的统计相关算法等。研究方向涵盖比较基因组学研究、基因编辑脱靶效应识别与临床应用优化，主持构建新冠病毒进化网络及生物医学大数据操作系统"Bio-OS"。
李亦学曾获全国五一劳动奖章、上海市科教兴市领军人才、上海市劳动模范等荣誉。
人物经历
1978年2月至1982年2月，李亦学就读于新疆大学。1984年9月至1987年7月，李亦学在新疆大学攻读理论物理硕士；1992年10月至1996年10月，李亦学获海德堡大学理论物理博士学位。1996年10月至1997年2月，李亦学在斯图加特大学从事博士后研究；1997年2月至2000年6月，李亦学在欧洲分子生物学实验室进行博士后工作。
2000年6月至2002年12月，李亦学任中国科学院上海生命科学研究院研究员。2002年2月至2023年12月，李亦学任上海科学院上海生物信息技术研究中心主任。2007年1月至2017年12月，李亦学任上海交通大学生命科学与技术学院生物统计学与生物信息学系系主任。2021年4月起，李亦学任广州实验室研究员。
2021年8月1日，2021年中国科学院院士增选初步候选人名单公布，李亦学位列其中。
2023年7月，“人工智能与药物设计”前沿学术论坛暨《人工智能与药物设计》新书发布会在上海举办，李亦学以“生物大数据操作系统：数据密集型科研技术底座”为题，介绍了Bio-OS生物医学大数据操作系统推动科学研究系统化和个性化的优势和实际应用、基于第一性原理的病毒演化趋势预测预警模型等研究成果。
2024年10月20日，第一届国际智能医学会议在上海召开，李亦学以《Employing deep learning technology to investigate the fitness-genotype landscape of 严重急性呼吸综合征CoV-2 and gauge its transmission rates》为题探讨了如何利用深度学习技术来研究SARS-CoV-2的适应度基因型景观，并评估其传播率。
2025年8月27日上午，人工智能赋能生物安全学术研讨会在中国农科院植保所举行，李亦学应邀做题为《人工智能&数据密集型科研范式及其应用》的专题报告。12月3日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心林鸿宣院士团队与上海交通大学林尤舜研究员团队、广州国家实验室李亦学研究员团队合作在国际权威学术期刊《细胞》（Cell）上发表题为“A stepwise decoding mechanism for heat sensing in plants connects lipid remodeling to a nuclear signaling cascade”的研究论文。该论文研究破解了水稻感知并响应高温的双重“密码锁”，揭示了植物中的一个循序激活、协同串联的热信号感知机制，并通过对该机制的遗传改良，成功培育出具有梯度耐热性的水稻新株系，助力作物耐高温分子育种，为应对全球变暖导致的粮食减产提供了新的解决方案。
研究领域
李亦学主要从事蛋白质组学、系统生物学研究，使用神经网络、统计物理等方法从事与脱氧核糖核酸序列相关的软件开发研究，特别发展了时间序列的统计相关算法等。研究方向涵盖比较基因组学研究、基因编辑脱靶效应识别与临床应用优化，主持构建新冠病毒进化网络及生物医学大数据操作系统"Bio-OS"。
主要作品
论文
参考资料：
专利
参考资料：
书籍
参考资料：
主要成就
申请发明专利8项，获得软件著作权15项，在基因编辑脱靶效应识别与临床应用优化工作中主持数据建模分析工作，取得突破性成果；构建数理模型和生物信息学分析工具集，支撑不同生命调控过程的解析与新冠病毒进化网络的构建。此外，李亦学主持开发生物医学大数据操作系统“Bio-OS”，以降低临床科研计算复杂度，支撑“智慧医疗数据密集型科研”范式的推广，为广大生物医学研究人员提供更为便利的生物医学大数据学习和分析平台。作为通讯和共同通讯作者在包括Nature，Science，Nature Communications，细胞 Stem Cell，Cancer Cell，Genome Research，Genome Biology，Genome Medicine，Molecular System Biology，Molecular Biology & Evolution，PNAS在内的专业杂志共发表科学论文300篇以上，引用23000次以上，H因子75。
社会职务
复旦大学泰州健康科学研究院科学顾问，上海生物信息技术研究中心主任，中国科学院上海生命科学研究院生物信息中心主任，中科院系统生物学重点实验室副主任。国家“十一五”863计划生物与医药领域专家组成员，上海市科学教育兴市领军人才。国家蛋白质机器重点研究计划、国家生物安全重点专项、国家常见多发病重点专项、国家生物与信息融合等重点专项专家组专家，上海交通大学教授，复旦大学遗传学教育部协同创新中心前沿生物技术部主任。
所获荣誉
参考资料：
参考资料 >
李亦学.李亦学.2025-12-04
李亦学.李亦学.2025-12-04
科学网-广州实验室李亦学课题组公开招聘.科学网-广州实验室李亦学课题组公开招聘.2025-12-04
学术报告.学术报告.2025-12-04
嘉宾日程介绍 | 苏冰/吴楠/李亦学/柯荣秦/蒋岚邀您参加2024（第七届）多组学研究与临床转化前沿论坛.生物谷.2025-12-04
关于公布2021年中国科学院院士增选初步候选人名单的公告.中国科学院.2021-08-28
关于公布2021年中国科学院院士增选初步候选人名单的公告.中国科学院.2025-12-04
人工智能+药物设计，华东师大团队加速推进!.中青在线.2025-12-04
第一届国际智能医学会议在沪成功举办，全球专家共探医智融合与创新.第一届国际智能医学会议在沪成功举办，全球专家共探医智融合与创新.2025-12-04
广州国家实验室李亦学研究员应邀来植保所做学术交流.广州国家实验室李亦学研究员应邀来植保所做学术交流.2025-12-04
破译“热警报”密码，中国科学家培育出具有梯度耐热性的水稻新株系.澎湃新闻.2025-12-04
我国科学家破解水稻高温感知机制 助力水稻稳产.央广网.2025-12-04